西雅图不思蜀--去美国暑期学校学统计是怎样的体验?

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作者:Siyu

 

想到西雅图,可能很多人第一印象会是星巴克、微软,或者张口就来文艺电影的名字《西雅图夜未眠》。西雅图还有一所华盛顿大学,这所大学的公共卫生专业在19年的US News排名第六,拥有着悠久的历史和丰厚的资源。

 

华盛顿大学西雅图分校的公共卫生学院生物统计系每年7月份(西雅图气候最宜人的时节,每天艳阳高照却穿长袖,晚上睡觉电扇都不用吹,明媚凉爽)举办为期四周的暑期学校(Summer Institutes)。笔者18年夏天去参加了一次,从知识、友谊到雪山盛景、当地美食,都收获满满,请听我细细安利。

 

暑期学校的学习内容

 

课程一般是从7月初至7月末四周。暑期学校的内容有四个大的方向:Statistical Genetics (SISG), Statistics for Big Data (SISBID), Statistics and Modeling in Infectious Diseases (SISMID),和Statistics for Clinical & Epidemiological Research (SISCER)。简单翻译一下,就是:遗传,大数据,传染病建模,和临床流病研究

 

两天半为一个主题(英文叫modules),以遗传为例,四周就有8个时间段,每个时间段有3个左右主题选择。比如7月15到17号的SISG,就有Bayesian Statistics for Genetics,Quantitative Genetics,Pathway & Network Analysis for Omics Data这三个主题可以选择,课程的种类比较丰富~

 

图1:华盛顿大学西雅图分校暑期学校主页

图2:SISG课程内容部分截图

 

学费和奖学金

 

普通报课没有特别的要求,就是填一些关于自己学术背景的资料。奖学金的申请在此之上,需要提交一份500字以内的个人陈述,讲讲自己对这个课程如何感兴趣,背景如何匹配这个课程;也需要自己的导师或者老板(supervisor)给自己写一封大概一页纸长度的推荐信。

 

这是暑期学校申请主页:

https://www.biostat.washington.edu/suminst

 

去年早鸟票一个modules是550美金,SISG有三个modules的奖学金,我就申请了三个奖学金,再交钱一共上了4个modules(即两周)。2019年学费有一定的调整,四个大方向各有不同,对于学术/政府/非盈利组织的参加者,早鸟票(5月31日之前)传染、大数据、传染病建模这三个是575美金,临床流病研究是650美金(哈哈哈哈,也许是觉得临床的比较有钱吧)。

图3:奖学金申请个人陈述要求

图4:奖学金申请之导师推荐信要求

 

去年SISG的奖学金很慷慨,基本上很多同学都是带着奖学金来上课的。看了一下,今年奖学金的情况发生了调整,SISG仍然有奖学金,但是仅针对研究生(graduate students), 还需要缴纳130美金的留位费。不过有总比没有好呀~~~奖学金是19年3月31号申请截止。因为学费比较贵,除非特别有钱,大家都是有选择性的上3-4个modules。

 

住宿和吃饭

 

华盛顿大学会提供学生宿舍,17年的情况是90美金一天(之前写信问过),18年的情况是100美元多一点一个单人间,因为我注册得比较早,得到的单间非常宽敞,采光也好。每一层宿舍都有厨房,可以自己带小锅和菜刀去煮饭。预计今年宿舍会涨价。

 

吃饭的话,丰俭由人,在外面吃,一天会花30-80美金。学校食堂一直开门,午市和晚市的自主是16美金左右,还挺好吃的~课程上午和下午分别有半个小时的茶歇,提供小吃。每周一和周三傍晚是reception,也会提供一些简餐,相当于是管了一顿饭(而这些茶歇和简餐正是老师和同学各种交流的黄金时段)。

 

图5:学校自助餐之水果部分

 

同学的情况

 

大部分是在美国高校读书的硕士和博士研究生,其中不乏名校,也有牛津、剑桥来的,感觉这帮同学特别爱抓住老师课后交流,还有墨西哥、中东国家、欧洲其他国家来的,比如让大家讨论个遍的克罗地亚(恰逢世界杯刚结束)。

 

中国同学也不少,但几乎都是在美国工作和读书的。内地直接跑去两周的好像只有我一个人(另外介绍一下我的情况,硕士毕业后在西南一家医院做流行病学相关的科研工作,我上这个课程的经费是老板和单位资助的,在这里想谢谢尊敬的boss和医院)。

 

我学到了什么以及我是怎么抱大腿的

 

我选了SISG (遗传中)的四门课,分别是Population Genetics, Computational Pipeline for WGS Data,Forensic Genetics,MCMC,即人群遗传学,全集因组测序流程,法医遗传学,蒙特卡洛马可夫链。

 

这些内容和我现在所做的研究工作都没有直接的关系,其中法医遗传学更是因为,我选的一门关于基因咨询的课只有我一人选没法开课,我看到同期的法医遗传学是整个大方向负责人Bruce Weir教授,抱着瞻仰大牛的心态改选的,后来发现整个班90%的同学是西雅图警察局法医技术部门的-_-||

 

因为我的近视有点严重,所以我的策略是起个大早,争取第一个到占最前排的位置,所以结识的同学都和我一样带点鸡血体质。比如第一门课Population Genetics,我们班第二个到的是一个叫Nicole的妹纸,在明尼苏达大学读犬类遗传学的博三,第一天通过聊天发现妹纸非常诚恳,于是我斗胆发出了晚上一起复习当天学习的内容的盛情邀请。

 

就这样第一周的头两个晚上,我都是在学习中度过。虽然我觉得我英语也还将就,其实听着陌生的学术内容还是会很懵。于是每天晚上说是互助学习,更不如说是我们翻到某张重要的PPT,Nicole用她的话给我讲一遍,碰到陌生的概念,她再跟我解释衍生一下,又是画图又是用数字说明。

 

Nicole说,其实这些内容没有和我们的研究内容直接相关,最有可能好好学习他们的时间,就是上网课的当晚,过了十天半个月再去翻PPT,忘记了大半会更加吃力。而且她也喜欢给别人上课,觉得如果能把知识给别人讲清楚,自己也梳理了逻辑,铁定掌握了知识。这两点让我获益匪浅,并借此贯穿到平时的学习之中

 

当晚若是遇到不明白的,Nicole就直接google原文看原文的解释,再不明白,就记下来,然后第二天早上问老师,简单直接明快。这门课的老师有两位,Ryan和Timothy教授也挺好的,后期有一些跑程序的内容,我有些跟不上,Timothy帮我解答的时候,还会跟Ryan说,请稍微慢一点,让她这边跟上了,再讲下一步。

 

当时我选对我来说完全陌生的Population Genetics,是因为几年前我看了加来道雄的一本畅想未来的科普书《Physics of the Future》,用人群的基因去看历史上地理的迁徙,被惊艳到。通过2天半的学习,感觉这个领域最热门的方法还是主成分分析和聚类。

 

在这门课结识了另一位非常温和的小伙伴Dan(恰好是第一天第三个到教室的),在宾大读人类遗传学的博一,课程结束后,他发了一篇相关领域比较新比较有趣的论文给我,发现这个领域的套路就是提出相关假设(比如鼻子的形状和气候适应有关),然后用模型来判别假设(不同地区鼻子变异的差异超过常规的变异genetic drift,即产生acclerated divergence,则认为气候适应对鼻子形状有影响),然后用数据放入模型来计算结果。

 

和Dan的后续交流和阅读相关领域文献都发生在课程结束以后,可见2天半的课能开启一些机会,不是直接学习知识,而是给到一些学习方法的启示,或者是结识一些有趣的人,再做一些深入的相关阅读。

 

图6:教室旁边就是湖,茶歇时可以去晒晒太阳

 

要说暑期学校是如何促进科研的?

 

我认为有几个方面。第一,2.5天为一个主题的课程非常精炼浓缩,可以通过这个module了解这个领域的人在做什么以及怎么做。如果能结合复习,跟老师提一些问题,就能进一步加深认识。

 

第二,来上这个课的小伙伴来自世界各地的高校,是做着不同东西的“大同行”,上下午的半小时课间休息到中午一起吃饭,大家天南地北的海聊,可以快速收获其他人在做什么,怎么做,做得怎么样。而且碰到一些小伙伴在做我感兴趣的东西(且我一知半解),可以在比较轻松的氛围下,请小伙伴解释给你听(比如我就抓住一个物理出身的小伙伴问建模的事情)。又比如周末一起爬山时,带队的姐们儿一直在跟我们讲她做疱疹病毒的研究。关于大家在做什么的交流,一直贯穿在生活当中。

 

图7:MCMC课程之老师上课的场景

图8:课后合影打卡,同学小伙伴的背景也很多元化

 

最后奉上最轻松的吃喝玩乐部分

 

西雅图可能是美国最舒适和安全的城市之一,夏天刚好是盛产樱桃的好时候,3.6美金就可以买一大盒樱桃(实现车厘子自由不是梦),因为滨海,有丰富的海产品,靠近华盛顿大学有一家Ivars以吃三文鱼为名,市中心摩天轮下由一家用木锤锤海鲜的蒸海鲜餐厅Crab Pot也非常有名。名景有每每出现在《实习医生格蕾》片头的太空针,剧粉一定要去打卡。

 

另外近郊有一座叫雷尼尔的雪山(在市中心派克市场的码头都可以看到),可以选择到雪山景区,爬山到1000米的观景台眺望雪山,美极了!另外笔者是文青,还在Benaroya Hall看了一场Seattle Symphony以星战背景音乐为主题的交响乐(电影的所有配乐包括21fox的开头全部由乐团完成,边看《星战》边欣赏配乐)。

 

图9:周末和同学小伙伴一起去爬雷尼尔雪山

图10:去Benaroya Hall打卡Seattle Symphony

 

我是因为17年暑假和在美国读博的小伙伴一起玩耍,小伙伴参加过,她推荐给我的,这么棒的暑期学校,也想安利给你~~工作的和研究生都可以参加哒~

 

(小咖的话:感谢医咖会小伙伴Siyu的经历分享,对本文中提到的暑期学校学习感兴趣或想了解更多的伙伴,可在下方留言,Siyu会尽可能给大家解答。)

 

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