雄心勃勃投入百万美金,计划重现50篇肿瘤文章的结果,然而...

2018-08-06 来源:

近日,Science官网发布了一篇文章《Plan to replicate 50 high-impact cancer papers shrinks to just 18》,介绍了一个雄心勃勃的项目在历经5年后,进展到底如何。

Reproducibility Project: Cancer Biology(RP:CP)项目,开始于2013年10月,目的是重现50篇高影响力的癌症生物学论文的实验结果,然而,随着时间的推进,这一数字被反复缩减,现在预计仅完成了18项研究

2013年,有两家制药公司称在重现很多癌症研究时都遇到了问题,为此,RP:CP项目被发起来公开检测癌症研究的可重现性。该项目与Science Exchange进行了合作,后者找到了合同实验室,来重现每篇文章中的一些关键性实验。资金来自Laura and John Arnold Foundation的130万美元资助,预期每项研究的费用约为2.5万美金实验预计需要1年。

该项目很快就引起原始研究的作者们的批判,他们担心无法重现出研究结果,因为这些实验室缺乏重现这些研究所需的专业知识。

随着项目进行,项目组织者意识到他们需要向原始研究作者索要更多的信息和材料,随之而来的就是成本上升和实验结果延迟,对这些结果进行同行评审也在耗费时间。

2015年底,组织者将论文列表减少到37个,在2017年1月又减少到了29个。接下来几个月,组织者又决定停止11项研究的重现性工作。Science Exchange的主席表示,18项已经完成的研究,平均每项研究花费了6万美金,其中有两项研究的花费异常高。

项目负责人Errington说,削减数量的一个原因是,为了得到有意义的结果,需要花费相当长的时间来排除故障或者优化实验。如果原始研究中包含了方法学细节,过程还能快一点。该项目还花了大量时间来寻找或重新制作无法从原始实验室拿到的材料,例如细胞系和质粒。

近日,Science官网发布了一篇文章《Plan to replicate 50 high-impact cancer papers shrinks to just 18》,介绍了一个雄心勃勃的项目在历经5年后,进展到底如何。

Reproducibility Project: Cancer Biology(RP:CP)项目,开始于2013年10月,目的是重现50篇高影响力的癌症生物学论文的实验结果,然而,随着时间的推进,这一数字被反复缩减,现在预计仅完成了18项研究

2013年,有两家制药公司称在重现很多癌症研究时都遇到了问题,为此,RP:CP项目被发起来公开检测癌症研究的可重现性。该项目与Science Exchange进行了合作,后者找到了合同实验室,来重现每篇文章中的一些关键性实验。资金来自Laura and John Arnold Foundation的130万美元资助,预期每项研究的费用约为2.5万美金实验预计需要1年。

该项目很快就引起原始研究的作者们的批判,他们担心无法重现出研究结果,因为这些实验室缺乏重现这些研究所需的专业知识。

随着项目进行,项目组织者意识到他们需要向原始研究作者索要更多的信息和材料,随之而来的就是成本上升和实验结果延迟,对这些结果进行同行评审也在耗费时间。

2015年底,组织者将论文列表减少到37个,在2017年1月又减少到了29个。接下来几个月,组织者又决定停止11项研究的重现性工作。Science Exchange的主席表示,18项已经完成的研究,平均每项研究花费了6万美金,其中有两项研究的花费异常高。

项目负责人Errington说,削减数量的一个原因是,为了得到有意义的结果,需要花费相当长的时间来排除故障或者优化实验。如果原始研究中包含了方法学细节,过程还能快一点。该项目还花了大量时间来寻找或重新制作无法从原始实验室拿到的材料,例如细胞系和质粒。

该项目已经在《eLife》上公布了18项研究中的10项研究的重现性结果。整体情况是:有5项研究,大部分结果是可以重现的;有3项研究还不能明确;有2项研究无法重现结果,不过这两项研究的发现之前已被其他实验室的结果证实。事实上,最初挑选的50篇论文,很多研究的结果都已被其他研究组所证实,这也是当初项目反对者们批评该项目的观点之一。

通过以下链接,查看10项研究的重现性结果

https://elifesciences.org/collections/9b1e83d1/reproducibility-project-cancer-biology

RP:CP项目团队正在撰写剩余8篇文章的结果,并对该项目进行Meta分析和总结。而中途被终止的11项研究的结果,将以brief的形式发表,项目负责人认为这些未完成的工作也是有价值的。

文章整理自:Plan to replicate 50 high-impact cancer papers shrinks to just 18. Science. Jul. 31, 2018

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