你不一定知道的论文写作利器——医学主题词表系统MeSH

这个题目想必大家看了会感到非常的奇怪。一般说来医学主题词表系统经常应用于文献的检索,那为什么说它是论文写作的利器呢?这是因为:

  • 无论是在论文写作还是在临床方案设计方面,都会用到对以往文献的检索。文献检索结果的全面性和精准性对论文,尤其是背景调研部分的质量起着关键的作用。
  • 在论文写作时,选用准确、合适的医学词汇,会使整个文章更加的专业、可信。
  • 在论文写作时,如何选择关键词,对论文发表后被检索及引用的次数有着至关重要的作用。

所以了解、理解并掌握医学主题词表系统,不仅能够使我们的文献检索结果更加的准确和全面,大大缩短我们在检索和阅读文献上花费的时间,提高效率。而且可以在撰写文章时,能够更加专业的表达我们的结果和想法。从今天起,我们准备用几期的篇幅来介绍一下什么是医学主题词系统,以及怎样使用这个系统。

Part.1 医学主题词表系统

要想了解医学主题词表系统,我们就必须要了解文献数据库的构成。文献数据库是由大量,经过索引的文献摘要,通过数据库的词表系统相互关联起来而构成的。如果把文献数据库比作一棵大树,词表系统是这棵大树的树干,而文献摘要则是树枝上的叶子。

医学主题词表,英文全称是Medical Subject Headings,简写为MeSH (广义的MeSH)。这也是PubMed医学主题词表的名称(狭义的MeSH)。除了PubMed,其他的医学文摘数据库,也有自己的主题词表系统(如EMbase 的词表系统叫做Emtree)。我们可以使用MeSH系统,查询与目标主题相关的词语内容并生成检索语句,进而在PubMed中进行文献检索。这样做可以明显的提高文献检索的准确性和查全率。今天,我们就来了解一下PubMed医学主题词(MeSH)系统。

Part.2 检索从MeSH开始

我们可以在MeSH的主页网站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/)中,查询与目标主题相关的主题词内容。例如,如果我们检索“非小细胞肺癌”相关的文献,我们可以在检索框中输入“non small cell lung cancer”(见图1-①)并点击检索。

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图1

在结果列表中,不难发现有 “Carcinoma, Non-Small-Cell Lung”的条目以及该条目的解释(见图1-②)。虽然条目的名称与所输入的检索词不同,但都同样指向“非小细胞肺癌”这一主题。不同的是,这里给出的条目名,是MeSH的优选词汇(Preferred Terms)。在主题词查询中,输入的关键词会自动映射成词表系统中相应的优选词汇,并在结果中显示。

点击该条目后,便可查看该条目的详情。在详情页面的众多内容中我们需要注意三个部分。按照页面的顺序分别是副主题词(SubHeadings)、同义词(Entry Term)和树状结构(Tree Structure)。

Part.3

(一)副主题词(Subheadings)

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图2

副主题词(Subheadings)又称限定词(Qualifiers),与主题词进行组配,对某一主题词的概念进行限定或复分,使主题词具有更高的专指性。如图2中所示,在“Carcinoma, Non-Small-Cell Lung”的条目下,有例如“基因学(genetics)”、“免疫学(immunology)”以及“治疗(therapy)”等多个对主题词“Carcinoma, Non-Small-Cell Lung”进行文献分类及限定的副主题词。如果用户在副主题词中,进行了如上图所示的组合勾选,并在整个PubMed中进行检索,得到的结果将仅仅包括非小细胞肺癌基因学、免疫学以及治疗方面的文献内容。

Part.4

(二)同义词(Entry Terms)

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图3

在MeSH的检索结果页面中,有一项叫做“Entry Terms” (如图3-①),或者称作“Cross-reference”(检查引用条目)。也就是说同一个意思的词汇,在不同的文献或信息来源中所采用的表达方式可能有所不同,也就是同义词的意思。MeSH系统之所以可以把所有的检索关键词都转化成优选主题词(Preferred Terms),就是因为它有完善的同义词表。用户无论输入同义词表中任何一个词,都可以达到同样的MeSH检索结果页面。比如我们在MeSH检索页面输入“non-small-cell lung carcinomas” (如图3-②),点击检索后,同样也可以得到图1的结果页面。

Part.5

(三)树状结构(Tree Structure)

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图4

树状结构(Tree Structure),又称统筹表系统(Categories and Subcategories)或层级关系视图(Hierarchy),是几乎所有医学词表系统的共同特点,MeSH词表也不例外。它将所有主题词按其学科性质、词义范围的上下类属及派生关系,分别划为19大类。每一类又分若干子类目,子类目下面又分若干更小的类目。我们通常使用的主题词,都按其学科概念的性质分别列入各自所属的类目之下(图4-①)。而我们点击“All MeSH Categories”(图4-②)可以查看所有19个大类的内容(图5-①)。

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图5

而在树状结构中,可以查看到主题词的上层主题和下层主题。越上层的词汇覆盖涵义越广,越下层的词汇越专指,彼此互为广义词(broad terms)及狭义词(narrow terms)关系。当我们点击上层主题词时,可以看到该广义词下的所有狭义词条目的信息。如,点击图5-②处的“Carcinoma, Bronchogenic”可以看到该主题词下包含两个狭义词:“Carcinoma, Non-Small-Cell Lung”以及”Small Cell Lung Carcinoma”。所以如果在主题词中选择“Carcinoma, Bronchogenic”并且在PubMed中进行检索,那么结果将包括这三个主题词的文献,称作为主题词的拓展检索。如果不想包括下层窄义词的内容,那么我们应该勾选副主题词下方的“Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy.”选项,这样检索结果会仅限于所选主题词的内容。

总结

今天,通过介绍了PubMed中的医学主题词表系统MeSH,我们发现:

  • MeSH词表除了提供医学主题词外,还提供具有限定作用的副主题词或者称之为限定词。
  • MeSH词表之所以可以将检索关键词映射成优选词汇,是基于其强大的同义词系统。
  • MeSH词表具备完善的树状结构,方便我们获取主题词的广义词及窄义词信息。

来源:君实医学