想通过比较母本等位位点reads和父本等位基因reads数差异显著性,了解该位点到底是偏母本还是偏父本。因为看到大多数文献推荐是用卡方检验(p<0.01)标准筛选,所以也想用这个标准,但不知道用什么软件,哪种卡方检验类型来做。数据如下:
gene_id 母本reads数 父本reads数
gene1 15 20
gene2 23 21