统计方法与比较结局的选择

老师,我的课题是比较A药和B药的疗效区别(分别有治疗前后两组数据),实验的疗效指标有多个,我尝试过应用t检验和秩和检验来分析结果,但得出的结论与理论不符,也曾用过卡方检验,同样结果不理想,所以我想请教下对于这个课题我所用的统计方法有没有错误?除此之外还可以用什么方法?结局比较应该是治疗后数据的比较?还是治疗前后的比较?谢谢!