3组比较,有独立,有非独立,用什么方法好

请问3组间比较,有些是来自同一个体颅内不同部位的肿瘤(颅内多发病灶),有些是单发的,按照部位分成3组,测量每个肿瘤磁共振的组学特征,都是定量数据,那3组间比较用什么方法好