什么是空间转录组学?

今天学习了一个新名词【空间转录组学】,简单总结一下:

空间转录组学是一个涵盖所有转录组数据分配到组织内原始位置的方法的总称。2020年被 Nature 评为年度技术,用于解析时间和空间维度上单个细胞的基因表达模式,以及细胞类群的空间位置关系即生物学特征。

因为每个细胞都受其直接周围环境的影响。因此,如果了解特定细胞周围的情况,就有助于我们理解为什么一个细胞以某种方式做出反应。

通过空间转录组学,可以获得单个细胞或一组细胞的转录组信息,同时保留细胞(或细胞组)在组织中的位置信息

在传统转录组学中 ,从组织或细胞群中提取RNA并进行测序,以确定样本的基因表达谱。然而,这种方法不提供组织内表达基因的空间分布信息。而空间转录组学通过在测序过程中物理保留组织内空间排列来克服这一局限性。