Nature:新冠病毒的动物来源,仍然迷雾重重
导语:穿山甲成为主要的怀疑对象,但是一系列基因分析还没有找到决定性的证据。
科学家们正在努力寻找在世界范围内造成爆发的新型冠状病毒的来源。三周前,中国科学家分析推测鳞片食蚁穿山甲是主要的怀疑对象[1]。但是科学家经过对这些数据和近期其他三项穿山甲冠状病毒基因组研究的数据进行分析,认为这种动物虽仍然是主要的怀疑对象,但谜团还远未解决。
公共卫生官员希望确定病毒的来源,以防止新的爆发。科学家认为,这种病原体是从动物传播到人身上的,就像其他冠状病毒一样。例如,研究者认为导致严重急性呼吸系统综合症(SARS)的病毒于2002年从果子狸传到人类身上。在此次疫情的爆发早期,数十例患者在武汉市的一个海鲜市场工作,但对市场上样品的检测尚无法确定此海鲜市场就是疫情爆发的来源。
广州华南农业大学的研究人员在2月7日的新闻发布会上,认为穿山甲是新型冠状病毒的动物来源。尽管中国禁止销售这种动物,但仍然有人从东南亚和非洲国家走私。研究人员表示,他们在走私的穿山甲中发现了一种冠状病毒,与新型冠状病毒的遗传匹配度高达99%。
但是上述数据并没有包含整个基因组分析。研究的作者表示,实际上,这与一个称为受体结合结构域(RBD)的特定位点有关。具体分析结果于2月20日在生物医学预印本服务器bioRxiv上发布[2]。全基因组比较发现,穿山甲病毒和人类冠状病毒DNA的相似性为90.3%。RBD是冠状病毒的重要组成部分,它使病毒能够锁定并进入细胞。新加坡的病毒学家Linfa Wang说,即使两种病毒的RBD之间的相似性高达99%,也不可作为充分证据将它们联系起来。
上周在bioRxiv上发布了三项类似的研究。其中的一篇论文(由一个国际研究小组于2月18日发表)发现[3],穿山甲冷冻细胞样品中的冠状病毒与人新冠病毒DNA的相似性在85.5%-92.4%之间。2月20日,中国的研究小组发表了另外两篇论文,也研究了走私穿山甲的冠状病毒,与新冠病毒相似性分别为90.23%[4]和91.02%[5]。
导语:穿山甲成为主要的怀疑对象,但是一系列基因分析还没有找到决定性的证据。
科学家们正在努力寻找在世界范围内造成爆发的新型冠状病毒的来源。三周前,中国科学家分析推测鳞片食蚁穿山甲是主要的怀疑对象[1]。但是科学家经过对这些数据和近期其他三项穿山甲冠状病毒基因组研究的数据进行分析,认为这种动物虽仍然是主要的怀疑对象,但谜团还远未解决。
公共卫生官员希望确定病毒的来源,以防止新的爆发。科学家认为,这种病原体是从动物传播到人身上的,就像其他冠状病毒一样。例如,研究者认为导致严重急性呼吸系统综合症(SARS)的病毒于2002年从果子狸传到人类身上。在此次疫情的爆发早期,数十例患者在武汉市的一个海鲜市场工作,但对市场上样品的检测尚无法确定此海鲜市场就是疫情爆发的来源。
广州华南农业大学的研究人员在2月7日的新闻发布会上,认为穿山甲是新型冠状病毒的动物来源。尽管中国禁止销售这种动物,但仍然有人从东南亚和非洲国家走私。研究人员表示,他们在走私的穿山甲中发现了一种冠状病毒,与新型冠状病毒的遗传匹配度高达99%。
但是上述数据并没有包含整个基因组分析。研究的作者表示,实际上,这与一个称为受体结合结构域(RBD)的特定位点有关。具体分析结果于2月20日在生物医学预印本服务器bioRxiv上发布[2]。全基因组比较发现,穿山甲病毒和人类冠状病毒DNA的相似性为90.3%。RBD是冠状病毒的重要组成部分,它使病毒能够锁定并进入细胞。新加坡的病毒学家Linfa Wang说,即使两种病毒的RBD之间的相似性高达99%,也不可作为充分证据将它们联系起来。
上周在bioRxiv上发布了三项类似的研究。其中的一篇论文(由一个国际研究小组于2月18日发表)发现[3],穿山甲冷冻细胞样品中的冠状病毒与人新冠病毒DNA的相似性在85.5%-92.4%之间。2月20日,中国的研究小组发表了另外两篇论文,也研究了走私穿山甲的冠状病毒,与新冠病毒相似性分别为90.23%[4]和91.02%[5]。
加拿大研究冠状病毒的专家Arinjay Banerjee说,为了确定宿主,遗传相似性应高于这些研究中报道的相似性。他指出,SARS病毒与果子狸冠状病毒的基因组有99.8%的相似性,这就是为什么人们把果子狸视为SARS病毒的来源。 Banerjee说,如果穿山甲是新型冠状病毒的起源,那也不是这些研究中的穿山甲。
到目前为止,在云南省的一只蝙蝠中发现了最接近人类冠状病毒的病毒。2月3日发表的一项研究[6]发现,蝙蝠冠状病毒与引起COVID-19的病毒的DNA相似性为96%。可能是蝙蝠将病毒传播给人类的,但是两种病毒的RBD位点之间存在一些关键性的区别。 研究人员说,表明这种特殊的蝙蝠冠状病毒并没有直接感染人,而是通过中间宿主将其传播给人的。
中国科学院动物研究所的专家蒋志刚表示,这些论文提出的问题多于答案。他问道,如果穿山甲是该病毒的来源,并且是从另一个国家来的,为什么没有关于该地区有人被感染的报道?
在武汉江汉大学研究动物行为的Sara Platto担心,所有关于穿山甲是来源的猜测都可能促使人们杀死穿山甲。SARS爆发后,大批果子狸被大量猎杀[7]。Platto说:“病毒传播的问题不在于动物,而在于我们与动物的接触”。
参考文章:
1.https://www.nature.com/articles/d41586-020-00364-2
2.https://doi.org/10.1101/2020.02.17.951335 (2020).
3.https://doi.org/10.1101/2020.02.13.945485 (2020).
4.https://doi.org/10.1101/2020.02.18.954628 (2020).
5.https://doi.org/10.1101/2020.02.19.950253 (2020).
6.https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7 (2020).
7.https://www.cbsnews.com/news/civet-cat-slaughter-to-fight-sars/
本文整理自:
https://www.nature.com/articles/d41586-020-00548-w
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